Pimpinan STAI An-Nawawi 2001-2002 :
Pelindung : KH. Achmad Chalwani
Ketua :  Drs. Miswadi
Pembantu Ketua I Bid. Akademik :  Mahsun M.Ag.
Pembantu Ketua II Bid. Adm. & Keuangan :  Drs. H. Nahrowie
Pembantu Ketua III Bid. Kemahasiswaan :  Drs. H.R. Mahsun Zain, M.Pd
Ketua Jurusan Mu'amalah  :  Drs. KH. Madchan Anies
Ketua Jurusan Aqidah Filsafat : -   
Pimpinan STAI An-Nawawi 2002-2005 :
Pelindung : KH. Achmad Chalwani
Ketua :  Mahsun M.Ag.
Pembantu Ketua I Bid. Akademik :  Sahlan, MSI.
Ketua II Bid. Adm. & Keuangan :  Drs. H.R. Mahsun Zain, M.Pd
Ketua III Bid. Kemahasiswaan :  M. Arwani, M.Pd.
Ketua Jurusan Mu'amalah  :  Drs. KH. Madchan Anies
Ketua Jurusan Aqidah Filsafat : -   
Pimpinan STAI An-Nawawi 2005-2010 :
Pelindung : KH. Achmad Chalwani
Ketua :  Mahsun M.Ag.
Pembantu Ketua I Bid. Akademik :  Sahlan, MSI.
Pembantu Ketua II Bid. Adm. & Keuangan :  Drs. H.R. Mahsun Zain, M.Pd.
Pembantu Ketua III Bid. Kemahasiswaan :  M. Arwani, M.Pd.
Ketua Jurusan Mu'amalah  : Taufiq Hidayat, Lc, MIS.
Sekretaris Jurusan Muamalah : Chaerul Imam, MSI.
Ketua Jurusan Aqidah Filsafat :  -  
Pimpinan STAI An-Nawawi 2010- sekarang  :
Pelindung : KH. Achmad Chalwani
Ketua :  KH. M. Wafi' M, Lc., MSI.
Pembantu Ketua I Bid. Akademik :  Sahlan, SAg, MSI.
Pembantu Ketua II Bid. Adm. & Keuangan :  Drs. H.R. Mahsun Zain, M.Pd.
Pembantu Ketua III Bid. Kemahasiswaan :  H. Taufiq Hidayat, Lc. MIS
Ketua Jurusan Mu'amalah  : Khaerul Imam, SHI, MSI.
Ketua Jurusan Aqidah Filsafat : (proses)
Ketua Jurusan PAI : (proses)
Ketua Jurusan Perbankan Syaria'ah : (proses) 
Kepala UPT :
Lab. Komputer dan Bahasa  : Drs. Wahyu Purwowitanto   
Kepala Bagian :
Tata Usaha : Miftahuddin, SHI, Anang, SHI.
Keuangan : Fathuddin, SHI, Muhaini, SHI.
Perpustakaan : Hikmah, SHI.
Arsiparis  : Muhajir, SHI.
Bagian Umum : Khamid